Alec Mason przybywa na Marsa z nadzieją na świeże życie. Perspektywa spokojnej przyszłości szybko jednak znika, gdy dochodzi do brutalnej interwencji Earth Defence Force. Stajesz na czele wyzwoleńczej armii, która w starciu z EDF ma szanse tylko przy użyciu walki partyzanckiej i wybuchowego sabotażu.